Az illető egyetem egyelőre ideiglenes működési engedéllyel rendelkezik, mely lehetővé teszi, hogy felvételit szervezzen, alapképzési szakokat indítson, oktatási és kutatási tevékenységet folytasson, de nem szervezheti meg az államvizsgát. A végleges akkreditációig az egyetemen végzett diákok más, államilag akkreditált egyetemen államvizsgáznak és az illető egyetem által kiállított oklevelet kapnak. Így nem merül fel az oklevelek „elismertségének” kérdése.A Sapientia Erdélyi Magyar Tudományegyetemen 2008-ig végzett hallgatók a kolozsvári Babeş–Bolyai Tudományegyetemen, a Bukaresti Egyetemen, a Temesvári Nyugati Egyetemen, a marosvásárhelyi Petru Maior Egyetemen, a brassói Transilvania Egyetemen, a bukaresti Műszaki Egyetemen, az Agrártudományi és Állatorvosi Egyetemen, a „I.L. Caragiale” Színház és Filmművészeti Egyetemen, valamint a Hyperion Egyetemen szereztek oklevelet. A végzett diákok (négy generáció) több mint 90 százaléka sikeresen államvizsgázott.

Az EMTE 2001 óta a román törvények értelmében ideiglenes működési engedéllyel rendelkezik. Az intézmény 2007-ben érkezett el oda, hogy kérvényezhette a 2001-ben indult szakjainak az akkreditációját. Így az EMTE 2007-ben hat, 2008 decemberében pedig további hat szak akkreditációs kérelmét nyújtotta be a Román Felsőoktatási Minőségbiztosítási Ügynökséghez. Az eljárási rendnek megfelelően jelen pillanatig négy szak (Informatika, Román nyelv és irodalom – angol nyelv és irodalom, Szociológia, Könyvelés és gazdálkodási informatika) esetében megtörtént az Ügynökség hivatalos jóváhagyása, amely javasolja a román kormánynak e szakok akkreditációját. Mivel a törvény által feltételként előírt három szak akkreditációját már megszerezte, 2009-ben az intézmény akkreditációját is kérvényezni fogja az egyetem. Az intézményi akkreditáció elnyerése meghatározó fontosságú az egyetem számára, hisz csak ezt követően adhat ki oklevelet, szervezhet mesteri és doktori képzést, illetve távoktatást.